La tradición del Hospital San Juan de Dios que data de 158 años, tiene gran cantidad de facetas que lo agigantan en la historia y lo colocan como una de las instituciones con mas arraigo popular, ya que como se ha dicho siempre no existe en Costa Rica una familia en la que no se tenga un pariente que no haya pasado por esta Benemérita Institución. Una de esas tradiciones de gran importancia en la estructura hospitalaria, tanto es así que a partir de la creación del Reglamento General de Hospitales se hizo obligatoria su aplicación en todos los hospitales del país, asumiéndolo después la Caja como una de las funciones de la Dirección Medica de cada Hospital, es el Consejo Técnico que por reglamento debe celebrarse cada mes, con la presencia de todas las Jefaturas Medicas y Administrativas y bajo la presidencia del Director General.