Se presenta el caso de una niña indígena de 7 años de edad, quien desarrolló un síndrome desinteriforme producido por Balantidium coli por espacio de cuatro años. La paciente ameritó tratamiento con tetraciclinas durante diez días. Se revisan los estudios de prevalencia publicados sobre el parásito en Costa Rica, comprobándose lo infrecuente e insidioso de la enfermedad. Se discuten las características clínicas y epidemiológicas del caso, haciéndose énfasis en la prevención y el diagnóstico precoz como las bases fundamentales del manejo de estos pacientes.