Con el fin de promover la ejecución de proyectos de investigación y ofrecer una propuesta para uniformar criterios y formas, se presenta una revisión sobre el tema de la investigación médica haciendo énfasis en el ensayo clínico como medio de investigación clínica con carácter experimental. En una primera parte se expusieron aspectos relativos a las fases de investigación clínica, al diseño y a la metodología experimental. En la presente revisión se describe la elaboración de protocolos de investigación con énfasis en sus diferentes apartados; se ofrecen elementos para la estimación adecuada del tamaño de la muestra y se señalan algunas observaciones de interés al momento de presentar, o bien revisar, el informe de un estudio científico. Finalmente, el tema se complementa con una aproximación general a las recomendaciones de contenido ético, necesarias para el buen desarrollo de los ensayos que sustentan la investigación en seres humanos.