Objetivo: Las malformaciones anorectales son una patología frecuente en el Servicio de Cirugía General del Hospital Nacional de Niños, sin embargo, en Costa Rica las publicaciones sobre el tema han sido pocas. El objetivo de este trabajo es analizar los pacientes operados entre 1998 y 2008, para conocer el detalle de los tratamientos usados y determinar cuál ha sido la experiencia, algo muy recomendable para que, con base en los hallazgos, se procesen las sugerencias para mejorar. Material y métodos: Se revisaron los expedientes y se examinaron los pacientes con malformaciones anorectales operados entre 1990 y 2008, controlados en la sección especializada de la Consulta Externa del Servicio de Cirugía General del Hospital Nacional de Niños. Los pacientes fueron agrupados de acuerdo con su tipo de anomalía, y fueron examinados para determinar: malformaciones congénitas asociadas, tipo de malformación anorectal, tipo de cirugía, complicaciones, y resultados de los siguientes exámenes: Ultrasonido de abdomen, CUMS, colografía distal y sus resultados funcionales, después de los tres años de edad. Los datos de los pacientes se digitaron en una base de datos del programa Excel, para analizarlos y tener una clara visión de los procedimientos empleados con cada grupo y de los resultados obtenidos. Resultados: Se controlaron 200 casos operados entre 1998 y 2008; en todos se estudiaron las malformaciones congénitas asociadas y su malformación anal, y se encontraron distintos tipos que fueron clasificados de la siguiente forma: los que tenían fístula, que se agruparon por el sitio donde la fístula desembocaba: a cuello vesical (12 casos), uretra prostática (12 casos), uretra bulbar (18 casos), vestibular (26 casos), perineal (92 casos), estenosis anal (12 casos); los que no tenían fístula: altos (16 casos) o bajos (3 casos), y finalmente, las malformaciones cloacales, tanto las altas (2 casos) como las bajas (7 casos). Todos los pacientes fueron operados con la técnica de Peña11 con las modificaciones para cada tipo. No se intervino ningún paciente con técnica laparoscópica. Conclusión: Se concluye que estos pacientes son muy complejos y deben estudiarse como un todo, ya que las malformaciones asociadas tienen mucha importancia en los resultados y la morbimortalidad. En la mayoría de los casos se obtienen buenos resultados. Lo importante en ellos es controlarlos por un tiempo prolongado, y usar los procedimientos necesarios para que se les permita llevar una vida normal, lo cual es posible.